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實驗室凈化車間的設計不同于其他類型的凈化車間，實驗室凈化車間不僅僅的只是選購合理的實驗室儀器設備，還需要綜合起來考慮實驗室整體規劃、實驗室合理布局、實驗室工藝流程、實驗室供電、給水、排水、實驗室通信、網絡、采暖、實驗室通風、實驗室空氣凈化、安全消防、環境保護等基礎設施和基本條件。因此，實驗室凈化車間建設是一項非常復雜的系統工程。先進的科學和優越完善的實驗環境是提升實驗室現代化的必備條件，智能、安全、*、舒適、節能、環保是實驗室凈化車間建設的理想要素。
實驗室凈化車間的建設要嚴格按照施工圖及相關規范作業，對于進場材料按規定進行抽查，測試，合格后方可使用。對于關鍵部位宜進行樣板制作業，待業主和監理工程師認可后大規模作業。
對于特殊制作工序，*制定特殊工序規定，潔凈車間施工人員應熟練掌握特殊工序的規定。應及時填寫作業檢查記錄和作業驗收記錄以及其他應予填報的記錄，做到文件與工程同步。
建造實驗室凈化車間工程時，設備材料應有防雨雪、防曬的措施，避免設備材料銹腐老化，對于空氣過濾器等重要器材與設備，應設置專門區域保管，統一全場成品保護和警示標識。
